Arbitrage is niet gratis, en zal vaak duurder uitvallen dan een procedure voor de rechtbanken. Veel zal echter afhangen van de arbitrageinstelling waarvoor partijen kiezen.
De meeste arbitrageinstellingen rekenen een forfaitaire kostprijs aan op basis van de waarde van het geschil, desgevallend te vermeerderen met de kosten van een deskundig onderzoek, indien het gaat om een technische discussie. Enkele arbitrageinstellingen werken met een uurtarief. Bij hen betalen de partijen enkel de reële kost van de deskundige, die tegelijk zetelt als arbiter (en dus niet louter een advies verstrekt zoals bij gerechtelijke procedures).
In tegenstelling tot de procedure voor de rechtbanken, zal de korte duur van de procedure en de afwezigheid van beroepsmogelijkheid (tenzij overeengekomen door partijen) uiteraard in belangrijke mate kostenbesparend werken.
De arbiters bepalen in hun arbitrale uitspraak wie de kosten van de procedure moet dragen of in welke verhouding.